في البداية كان قسم الرياضيات أحد الأقسام العلمية بكلية المعلمين بعرعر والتي عملت تحت مظلة وزارة التربية والتعليم آنذاك، حيث بدأت في استقبال الطلبة في عام 1408، ومن ثم تم ضم القسم الى كلية العلوم بعد إنشائه في 26/5/1426هـ وذلك بعد إنشاء. 

 يعمل القسم على تقديم برامج دراسية تغطي مجالات العلوم الرياضية المختلفة حيث يقدم برنامج بكالوريوس الرياضيات كما تم استحداث برنامجين آخرين وهما برنامج بكالوريوس الإحصاء التطبيقي وبرنامج بكالوريوس الرياضيات المالية. علاوة على ذلك فإن القسم مسؤول عن تدريس مقررات الرياضيات والإحصاء في مختلف كليات الجامعة مثل كلية الهندسة وكلية الطب والتمريض والعلوم الطبية التطبيقية. 

يضم القسم نخبة من أعضاء هيئة التدريس المتميزين والذين يقومون بالإضافة الى التدريس بالإنتاج العلمي الرصين مما يسهم في إثراء المعرفة الإنسانية ويسهمون في خدمة المجتمع. يسعى القسم من خلال برامجه المتنوعة وما يوفره من بيئة تعليمية الى تقديم تجربة تعليمية مميزة بما يسهم في إعداد كوادر مؤهلة وقادرة على الانخراط في سوق العمل عالمية والاسهام في تنمية المجتمع.